广州健康院以为国家和区域发展作贡献为己任，高度重视与地方政府、企业及国家创新体系中其他单位的联合合作，以科技促经济，服务于区域经济建设和社会发展需要。
加强区域合作，与高校、企业共建联合研究中心，协同攻关。与广州医科大学共建“干细胞转化医学中心”，双方共同配置和利用现有科研-临床资源，促进基础研究成果临床应用转化；与香雪集团共建“健康院香雪联合实验室”，合作开发高亲和性PD-1蛋白，作为肿瘤免疫治疗中的联合药物之一，旨在获得比现有抗体相当或更优质的治疗性蛋白，共同推进国内细胞免疫治疗进程。
（共建“干细胞转化医学中心”签约仪式）
建设科技创新平台，辐射带动区域产业升级。广州健康院建有完善的所级科研条件综合支撑中心、多个关键技术特色支撑平台以及重点实验室，对周边生物医药企业的聚集起了重要的辐射作用。其中，公共服务平台设有分析测试中心、实验动物中心、生物医学数据与超算中心、治疗性细胞制备研究中心、移动式生物安全三级实验室等；关键技术特色支撑平台设有CNAS认证的细胞标准化检测实验室、实验动物模型平台、转基因克隆大动物技术平台、生命科学装备研发服务平台、分子诊断技术平台、临床前药物评价技术平台、结构生物学技术平台等；建成中国科学院再生生物学重点实验室、广东省干细胞与再生医学重点实验室及广东省生物医药计算重点实验室，并与广州呼吸病研究院联合共建呼吸疾病国家重点实验室。
同时，广州健康院还牵头建立了中国科学院广州生命科学大型仪器区域中心，整合区域大型仪器资源，提升设备利用率及服务效率。此外，鼓励科学家深度参与企业关键技术攻关，通过派出科技特派员、提供技术定制服务等多种方式与国内上百家企业开展合作，充分发挥科技创新平台对产业的支撑作用，推进科技创新供给侧与需求侧的融合，助力区域产业升级。
（细胞标准化检测实验室获CNAS认可证书）
加强互访交流，促进科技合作。广州健康院始终坚持“开放共享，合作共赢”的理念，与地方政府、企业、高校及科研机构保持合作交流。
（王福生院士到广州健康院进行学术交流）
（赵国屏院士到广州健康院进行学术交流）
（东盟经济特区政府主席赵伟来访生物院）
（广东省发展与改革委副主任蔡木灵调研广州生物院）
（恒大健康集团到健康院交流合作）
（广州产学研之“走进实验室”活动）
